Bakom Hjärnkoll står organisationerna som ingår i Nationell Samverkan för Psykisk Hälsa (NSPH). Mellan 2009 och 2014 var Hjärnkoll en nationell kampanj som drevs av Myndigheten för delaktighet i samarbete med NSPH. Sedan 2015 är vi ett riksförbund. Vårt arbete leds av en styrelse. Riksförbundet har också ett kansli.